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목록전체 글 (278)
데이터 과학
A. Bundibugyo Ebolavirus (BDBV)Bundibugyo ebolavirus, confirmed as Ebola in 2007, as new species of Ebola in 2008. It is one of four ebolavirus that causes EVD in humans. EVD due to BDBV infection cannot be differentiated from EVD caused by other Ebolaviruses by clinical observation alone. An epidemiological study determined there were 116 confirmed and probable cases of the new Ebola species, B..
서논술형평가 관련 내용은 알려져 있는 교과에서는 여러 방향으로 연구되고 있고 이에 대한 지표도 잘 나와 있는 상황입니다. 2022 개정교육과정에서는 인공지능 내용들이 많이 첨가 되었습니다. 정보수업에서 인공지능 관련 논술형 평가 예시입니다. 이 자료는 경기도 교육청 중등 논술형 평가 문항 예시자료입니다. 지능 에이전트 이해하기 자료입니다. https://www.goe.go.kr/goe/na/ntt/selectNttInfo.do 참고자료: http://contents2.kocw.or.kr/KOCW/document/2019/keris/edu2/6.pdf
Reduce는 PDB 구조 파일에 수소 원자를 추가하고, 기존 원자의 방향을 최적화해 주는 도구입니다. The Richardson Lab (Duke University)에서 개발했으며, 특히 X-ray 결정구조에서는 빠져 있는 수소 원자를 보완할 때 자주 사용됩니다. 주요 기능은 다음과 같습니다. 수소 원자 자동 추가대부분의 실험 구조(PDB)는 수소를 포함하지 않음 → Reduce가 자동으로 적절히 배치Side-chain orientation 조정Asn, Gln, His 등 방향성이 모호한 잔기들의 방향(아민/아마이드/이미다졸)을 수소 결합에 맞게 회전시킴입체화학/수소 결합 고려가능한 수소 결합을 고려해 구조의 입체화학을 개선 아래와 같은 명령어로 수소가 없는 PDB 구조에서 수소가 추가된 구조를 ..
간단한 PDB (Protein Data Bank) 형식의 예제 파일을 파이썬 코드로 생성을 해 보면 아래와 같습니다. pdb_content = """\ HEADER TEST PDB FILE 09-MAY-25 TITLE SIMPLE ALANINE DIPEPTIDE ATOM 1 N ALA A 1 11.104 13.207 10.349 1.00 20.00 N ATOM 2 CA ALA A 1 12.560 13.107 10.516 1.00 20.00 C ATOM 3 C ALA A 1 13.108 14.515 10.877 1.00..
IEEE에서 발표된 연구로, 헬리코박터 파일로리(Helicobacter pylori, 이하 H. pylori) 감염에 대한 치료제로서 만노스 결합 렉틴(Mannose-Binding Lectin, MBL)의 가능성을 데이터 마이닝 기법을 활용하여 분석한 내용을 담고 있습니다. 논문은 MBL의 면역학적 역할과 H. pylori 감염과의 상호작용을 탐색함으로써, MBL을 기반으로 한 새로운 치료 전략의 가능성을 제시합니다. H. pylori는 위염, 위궤양, 위암 등 다양한 위장 질환의 주요 원인균으로 알려져 있으며, 전 세계 인구의 절반 이상이 감염되어 있습니다. MBL은 선천 면역계의 중요한 구성 요소로, 병원체의 표면에 존재하는 특정 당 구조를 인식하여 보체 경로를 활성화하고, 식균작용을 촉진하는 역할을..
🧬 PDB (Protein Data Bank, 단백질 정보 은행)은 1971년에 설립된 단백질 구조 데이터 저장소입니다. RCSB (Research Collaboratory for Structural Bioinformatics)가 운영하기에 RCSB PDB 사이트라고 명명합니다. 간단하게 역사를 살펴보면 다음과 같습니다. 1970년대: 단백질 구조 아카이브 설립 논의, 1971년 브룩헤이븐에서 PDB 설립(7개 구조).1980년대: 기술 발전으로 구조 수 증가, 구조 제출 요구에 대한 논의, IUCr 가이드라인 수립.1990년대: 구조 유전체학 시작, PDB가 RCSB PDB로 이전.2000년대: wwPDB 설립, 2008년 4월에 50,000번째 구조 공개 PDB 사이트에서는 단백질, DNA, ..
쇼어의 소인수 분해 알고리즘으로 이전의 암호문제를 해결할 수 있습니다. RSA 알고리즘이 현대 암호학의 기반을 이뤄어냈다고 과언이 아닐 텐데 이에 대한 암호를 해결할 수 있는 알고리즘이 양자알고리즘을 통해 나오고 있습니다. 쇼어 알고리즘을 정리하면 다음과 같습니다. 예시로 91을 소인수 분해하는 과정을 쇼어 알고리즘 방식으로 풀어봅시다. 91=?x? 어떠한 연산값을 먼저 추정해야 하는데 여기서 a=3이라고 정의해 봅시다. f(x) = a^x mod N 으로 정의하면 f(x)=3^x mod 91이 만들어집니다. 이를 한번 계산해 보면 3^1 mod 91=33^2 mod 91=93^3 mod 91=273^4 mod 91=813^5 mod 91=633^6 mod 91=9 ( 패턴 반복 시작)3..
AbstractUseful insight into the evolution of genes and gene families can be provided by the analysis of all available genome datasets rather than just a few, which are usually those of model species. Handling and transforming such datasets into the desired format for downstream analyses is, however, often a difficult and time-consuming task for researchers without a background in informatics. Th..
인공지능을 처음 시작하는 분들에게 소개하는 시각화 하는 툴입니다. 인터페이스가 SPSS 클레멘타인과 비슷하며 프로그래밍을 잘 몰라도 마우스 클릭 몇 번만 하면 사용을 할 수 있는 프로그램입니다. R언어나 판다스는 프로그래밍을 배워야 하며 라이브러리를 설치해서 콘솔환경에서 작업을 해야 하는데 ORANGE는 GUI (그래픽 유저 인터페이스) 환경에서 작업을 하기에 상당히 간단하고 편리한 프로그램입니다. https://orangedatamining.com/ Orange Data MiningOrange Data Mining Toolboxorangedatamining.com 위 사이트에 접속하여서 최신판들 다운로드 받으면 됩니다. 플랫폼이 맥OS도 지원하기에 운영체제 문제로 고민할 필요는 없습니다. 버전..