데이터 과학

RTX 5060 , SSD 2TB 환경 기준RoseTTAFold-All-Atom은 단백질뿐 아니라 DNA, RNA, 작은 분자, 금속 이온을 포함한 복합체 구조를 예측할 수 있는 인공지능 기반 구조 예측 도구입니다.기존 RoseTTAFold가 주로 단백질 구조 예측에 초점을 맞추었다면, RoseTTAFold-All-Atom은 실제 생체 환경에 가까운 복합체를 다룰 수 있도록 확장된 모델입니다.이 글에서는 다음 환경을 기준으로 설치 과정을 설명합니다. 항목기준 환경운영체제Ubuntu 24.04 LTSGPUNVIDIA GeForce RTX 5060GPU 메모리8GB 기준저장장치SSD 2TB설치 대상RoseTTAFold-All-AtomPython 환경Miniforge·Mamba실행 방식로컬 GPU 실행1. 설..

단백질 구조 예측이 어려운 이유와 AlphaFold·ColabFold·RoseTTAFold의 활용생명과학에서 단백질의 구조를 이해하는 일은 매우 중요합니다. 단백질은 세포 안에서 화학 반응을 촉진하고, 물질을 운반하며, 외부 신호를 전달하고, 병원체를 인식하는 등 거의 모든 생명현상에 관여합니다. 그러나 단백질의 기능은 아미노산이 어떤 순서로 연결되어 있는지만으로 결정되지 않습니다. 아미노산 사슬이 실제 공간에서 어떤 3차원 형태로 접히는지가 기능을 결정하는 핵심 요소입니다. 최근에는 AlphaFold, ColabFold, RoseTTAFold와 같은 인공지능 기반 도구가 등장하면서 아미노산 서열로부터 단백질 구조를 빠르게 예측할 수 있게 되었습니다. 특히 AlphaFold2는 실험 구조에 근접한 정확도..