데이터 과학

A. Bundibugyo Ebolavirus (BDBV)Bundibugyo ebolavirus, confirmed as Ebola in 2007, as new species of Ebola in 2008. It is one of four ebolavirus that causes EVD in humans. EVD due to BDBV infection cannot be differentiated from EVD caused by other Ebolaviruses by clinical observation alone. An epidemiological study determined there were 116 confirmed and probable cases of the new Ebola species, B..

Reduce는 PDB 구조 파일에 수소 원자를 추가하고, 기존 원자의 방향을 최적화해 주는 도구입니다. The Richardson Lab (Duke University)에서 개발했으며, 특히 X-ray 결정구조에서는 빠져 있는 수소 원자를 보완할 때 자주 사용됩니다. 주요 기능은 다음과 같습니다. 수소 원자 자동 추가대부분의 실험 구조(PDB)는 수소를 포함하지 않음 → Reduce가 자동으로 적절히 배치Side-chain orientation 조정Asn, Gln, His 등 방향성이 모호한 잔기들의 방향(아민/아마이드/이미다졸)을 수소 결합에 맞게 회전시킴입체화학/수소 결합 고려가능한 수소 결합을 고려해 구조의 입체화학을 개선 아래와 같은 명령어로 수소가 없는 PDB 구조에서 수소가 추가된 구조를 ..

간단한 PDB (Protein Data Bank) 형식의 예제 파일을 파이썬 코드로 생성을 해 보면 아래와 같습니다. pdb_content = """\ HEADER TEST PDB FILE 09-MAY-25 TITLE SIMPLE ALANINE DIPEPTIDE ATOM 1 N ALA A 1 11.104 13.207 10.349 1.00 20.00 N ATOM 2 CA ALA A 1 12.560 13.107 10.516 1.00 20.00 C ATOM 3 C ALA A 1 13.108 14.515 10.877 1.00..

IEEE에서 발표된 연구로, 헬리코박터 파일로리(Helicobacter pylori, 이하 H. pylori) 감염에 대한 치료제로서 만노스 결합 렉틴(Mannose-Binding Lectin, MBL)의 가능성을 데이터 마이닝 기법을 활용하여 분석한 내용을 담고 있습니다. 논문은 MBL의 면역학적 역할과 H. pylori 감염과의 상호작용을 탐색함으로써, MBL을 기반으로 한 새로운 치료 전략의 가능성을 제시합니다. H. pylori는 위염, 위궤양, 위암 등 다양한 위장 질환의 주요 원인균으로 알려져 있으며, 전 세계 인구의 절반 이상이 감염되어 있습니다. MBL은 선천 면역계의 중요한 구성 요소로, 병원체의 표면에 존재하는 특정 당 구조를 인식하여 보체 경로를 활성화하고, 식균작용을 촉진하는 역할을..