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데이터 과학
RoseTTAFold-All-Atom에서 데이터베이스와 분석RoseTTAFold-All-Atom(RFAA)을 로컬 컴퓨터에 설치하다 보면 UniRef30, BFD, PDB100, Legacy BLAST 2.2.26과 같은 여러 종류의 데이터와 프로그램을 설치하게 됩니다. 처음 접하면 이 네 가지가 모두 비슷한 데이터베이스처럼 보이지만 실제 역할은 상당히 다릅니다.UniRef30과 BFD는 단백질의 진화적 정보를 찾기 위한 서열 데이터베이스이고, PDB100은 이미 알려진 단백질의 3차원 구조를 참고하기 위한 구조 템플릿 데이터베이스입니다.Legacy BLAST 2.2.26은 데이터베이스가 아니라 단백질 서열을 검색하고 비교하는 데 사용되는 분석 프로그램입니다. RoseTTAFold-All-Atom의 구조..
RTX 5060 , SSD 2TB 환경 기준RoseTTAFold-All-Atom은 단백질뿐 아니라 DNA, RNA, 작은 분자, 금속 이온을 포함한 복합체 구조를 예측할 수 있는 인공지능 기반 구조 예측 도구입니다.기존 RoseTTAFold가 주로 단백질 구조 예측에 초점을 맞추었다면, RoseTTAFold-All-Atom은 실제 생체 환경에 가까운 복합체를 다룰 수 있도록 확장된 모델입니다.이 글에서는 다음 환경을 기준으로 설치 과정을 설명합니다. 항목기준 환경운영체제Ubuntu 24.04 LTSGPUNVIDIA GeForce RTX 5060GPU 메모리8GB 기준저장장치SSD 2TB설치 대상RoseTTAFold-All-AtomPython 환경Miniforge·Mamba실행 방식로컬 GPU 실행1. 설..