BIO EDIT 사용법

NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)에서 FASTA 형식의 서열들을 다운 받는다.

 

실험을 위해 5개의 spike SARS 단백질 서열들을 다운 받았다. GENBANK 아이디로 검색하면 서열이 나오는데 그것을 하나의 파일로 저장해 놓자.

 

QBM11748.1

AAR86788.1

QHR63290.2

AVP78031.1

QIA48632.1

 

FASTA 포맷

BioEdit에서 FASTA 서열을 불러온 다음 블록으로 처리 한 후 메뉴중

Accessory Application -> ClustalW Mutiple Aligement를 선택 한 후 Run ClustalW를 실행하면 된다.

BioEdit 다운로드 받는 곳. (https://bioedit.software.informer.com/7.2/)

 

BioEdit 에서 서열정리 

ClustalW

BioEdit에서 Mode를 Edit로 변경 한 후 마우스 드래그를 하여 공백을 삭제하거나 길이를 자르면 된다.

 

 

파일 저장을 FASTA 형식으로 저장한다.