코로나 바이러스 nsp13, nsp14 구조 확인 (pymol)

Pymol 프로그램을 이용한 코로나 바이러스 nsp13과 nsp14 구조 내용입니다. 

 

이 내용은 "AlphaFold3를 이용한 SARS-CoV-1, MERS-CoV 및 SARS-CoV-2 비구조 단백질의 도메인 수준 서열 및 구조 보존성 비교" 주제로 시스템 생물학의 구조 분석을 위한 내용으로 작성된 부분입니다. 논문에서는 plDDT 값을 추정하여 나타냈는데 이 자료에서는 좀 더 보기 편한 pymol에서 cif 파일을 불러와서 오버레이를 하였습니다. 

 

코로나바이러스의 대표적인 비구조 단백질은 다음과 같습니다.

- nsp12: RNA 의존성 RNA 중합효소로, 바이러스 RNA를 합성한다.
- nsp13: 헬리케이스(Helicase)로, RNA의 이중 구조를 풀어준다.
- nsp14: RNA 복제 오류를 교정(Proofreading)하고 RNA 캡 형성에 관여한다.

비구조 단백질은 바이러스의 형태를 만드는 단백질이 아니라, 바이러스가 세포 안에서 복제하고 증식하는 데 필요한 기능을 담당하는 단백질입니다.

 

 

 

nsp13

 

 

 

 

 

 

 

 

Overlay_nsp13_3viruses.pse

8.40MB

 

nsp14

 

 

 

 

 

 

 

 

Overlay_nsp14_3viruses.pse

8.41MB