바이오 파이썬 설치 방법

바이오 파이썬 설치 방법에 대한 안내 

 

Anaconda 기준으로 설명 

 

1. Anaconda를 설치 한다. 

2. 주피터 노트북을 실행한다. 

 

 

아나콘다 설치와 주피터 노트북은 파이썬 사용자라면 기본적으로 설치가 되어 있을 것으로 판단.

 

https://www.anaconda.com/products/individual

Anaconda | Individual Edition

 

위 사이트에서 다운로드 받으면 됩니다. 

 

바이오 파이썬 홈페이지는 다음과 같습니다. 한번쯤 방문해서 홈페이지 투어해 보세요. 

 

https://biopython.org/

Biopython · Biopython

 

 

튜토리얼을 읽어보면 사용방법과 설치방법등이 나오는데 쉽게 설치 하는 방법은 다음과 같습니다. 

 

Anaconda Prompt를 실행한 다음 콘솔창에 다음과 같은 명령어로 입력하면 됩니다. 

 

conda install -c conda-forge biopython

 

 

 

콘솔에서 설치가 끝나면 주피터 노트북을 실행합니다. 

실행한 후에는 바이오 파이썬이 잘 설치가 되었는지 라이브러리를 불러와 봅니다. 

에러가 없는지 확인해 봅니다. 

 

 

에러가 없네요. 설치가 잘 되었습니다.

지금부터는 튜토리얼을 보면서 바이오 파이썬을 실습해 보면 됩니다. 

 

 

튜토리얼은 다음과 같습니다. 한번 읽어보면 대략적인 바이오 파이썬에 대한 내용이 나옵니다. 

http://biopython.org/DIST/docs/tutorial/Tutorial.html#sec10

Biopython Tutorial and Cookbook

 

NCBI 사용방법과 Genbank 서열 정렬 응용방법은 정리후 올려 놓겠습니다.