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데이터 과학

PAM과 BLOSUM

서열 정렬 서열 정렬 및 데이터베이스 검색 프로그램에서는 정렬을 통해 문자값을 가지고 비교하며 이에 대해 점수표(Scoring Matirix)를 활용하는 방법을 사용합니다. 방법1. 행렬의 점수를 정수 값으로 설정하고 동일하거나 유사한 쌍(pair)에는 양수가 부여되고 유사하지 않은 쌍(pair)은 음수 또는 0점을 부여합니다. 방법2. 일치성에 대한 점수를 설정하기는 방법으로는 문자가 일치 할때는 점수 1점을 부여하고 일치하지 않으면 점수 0점을 부여 합니다. 방법3. DNA 점수 반영에서 점수를 만들어 낼때는 일치성을 3, 번역(transition) 2 점과 transversions 에서는 0점을 설정합니다. 방법4. 단백질에서는 화학적 유사성 점수를 반영해야 하는데 유사한 화학적 고유 특성을 가진 ..
생명정보학 & 화학정보학/NCBI와 블라스트 2021. 11. 1. 15:17
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